农业生物技术学报

作者：孙宇, 刘志鑫, 叶子, 高爱平, 罗睿雄, 蒲金基, 张贺

单位：1海南大学 植物保护学院/热带农林生物灾害绿色防控教育部重点实验室,海口 570228;2中国热带农业科学院 环境与植物保护研究所/农业农村部热带作物有害生物综合治理重点实验室,海口 571101;3中国热带农业科学院 热带作物品种资源研究所,海口571101

关键词：杧果,双B-box结构域锌指蛋白(DBB)基因家族,全基因组鉴定,表达分析,

基金：国家重点研发专项(2019YFD1000504); 中国热带农业科学院基本科研业务费专项资金(1630042021022; 1630042017019)

B-box蛋白是一类锌指结构转录因子,其功能具有普遍性和特异性。为了揭示双B-box结构域锌指蛋白(double B-box, DBB)基因家族在杧果(Mangifera indica)中的序列特征及其表达特性,本研究以杧果全基因组数据为基础,采用生物信息学的方法对杧果DBB基因家族成员进行序列分析,并通过qRT-PCR技术研究杧果胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides, Cg)和细菌性黑斑病菌(Xanthomonas campestris pv. mangiferaeindicae, Xcm)侵染过程中杧果DBB基因家族成员的相对表达量。结果表明,从杧果基因组中鉴定了9个DBB基因家族成员,命名为MiDBB1~9,9个MiDBBs蛋白均为不稳定亲水酸性蛋白,主要定位于细胞核中,不仅三级结构类似,N端还具有相同位点的两个保守结构域(B-box1和B-box2)。根据蛋白结构预测、系统发育关系、保守基序及多重序列比对分析推测,杧果DBB基因家族在进化上具有结构保守性,功能上具有相似性。杧果与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、烟草(Nicotiana tabacum)、苹果(Malus domestica)、菠萝(Ananas comosus)和毛果杨(Populus trichocarpa)构建的系统发育树显示,杧果DBB与毛果杨DBB亲缘关系最近,其次是苹果。qRT-PCR结果显示,胶孢炭疽菌侵染过程中,MiDBB1~9的相对表达量在12~48 h内持续上调,细菌性黑斑病菌侵染过程中,MiDBB2和MiDBB3的相对表达量在12~72 h内持续上调,初步确定了杧果DBB基因表达受胶孢炭疽菌和细菌性黑斑病菌的诱导。本研究结果为后续研究杧果DBB基因家族成员的功能和作用机制提供参考。

来源：2021年第12期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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