农业生物技术学报

作者：吴小敏, 倪锴, 朱晓锋, 谌颖莲, 赵佳福, 许厚强

单位：1 贵州大学 高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵阳 550025;2 贵州大学 动物科学学院,贵阳 550025;3 贵州大学 生命科学学院,贵阳 550025

关键词：PRKAA1(protein kinase,AMP activated α1),LncRNA,差异表达,肉质性状,脂肪沉积,

基金：国家科技支撑计划(2015BAD03B02-3); 贵州畜禽种质资源保存创新与利用[黔科合重大专项字(2013)6008]

PRKAA1 (protein kinase, AMP activated α1)在脂肪代谢、细胞增殖和脂肪形成等过程具有重要的调控作用。为探究PRKAA1基因相关长链非编码RNAs (long noncoding RNAs, LncRNAs)的表达规律,本研究以贵州脂肪型猪种从江香猪(Sus scrofa)和商品型猪种约克夏(S. scrofa)为研究对象,根据猪PRKAA1 mRNA (GenBank No.XM_021076521)的3'UTR序列,利用NCBI和NONCODE (http://www.noncode.org/)对PRKAA1相关的LncRNAs进行筛选;对筛选的LncRNAs克隆并对序列二级结构、ORF、与PRKAA1作用的靶位点以及调控的miRNAs等进行预测;以qRT-PCR技术检测所筛选LncRNAs在从江香猪和约克夏各组织中的表达情况。选择NONSUST030689.1 (命名为ALNC1)和NONSUST004358.1 (命名为ALNC2)两条候选LncRNAs进行研究;克隆测序发现ALNC2对比原序列增加了46 bp;ALNC1具有4个ORFs,ALNC2具有5个ORFs;此外,ALNC1和ALNC2与PRKAA1作用的靶位点各1个;预测出能与LncRNA结合的miRNA (microRNA)主要有miR-1226-5p、miR-487b-5p、miR-7156-5p等;qRT-PCR检测结果显示,2条LncRNAs在从江香猪和约克夏各组织中均普遍表达,各组织间表达差异明显;ALNC1与ALNC2在从江香猪肝脏和脾脏中表达最高,背最长肌中最低;在约克夏大肠和肺脏中表达最高,背最长肌中表达最低;ALNC1在从江香猪肝脏、脾脏、小肠、脂肪和背最长肌的表达量极显著高于约克夏(P<0.01),心脏和大肠中表达量低于约克夏(P<0.01),在肺脏和肾脏中约克夏与从江香猪的表达差异不显著。ALNC2在肝脏、肾脏、背最长肌表达量极显著高于约克夏(P<0.01),心脏、肺脏、大肠、小肠中表达量极显著低于约克夏(P<0.01);脂肪中显著低于约克夏(P<0.05),脾脏中表达差异不显著。本研究结果可为深入探讨PRKAA1及相关LncRNAs在猪脂肪沉积中的调控作用提供基础资料。

来源：2020年第2期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

查看农业生物技术学报杂志2020年第2期