农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2020年第5期:马铃薯StUBC12基因的生物信息学及表达特性分析

发布日期:

作者:付学, 唐勋, 刘维刚, 李世贵, 祁学红, 张宁, 司怀军

单位:1 甘肃农业大学 生命科学技术学院,兰州 730070;2 甘肃省干旱生境作物学省部共建国家重点实验室培育基地,兰州 730070;3 甘肃农业大学 农学院,兰州 730070

关键词:马铃薯,StUBC12,生物信息学,表达分析,

基金:国家自然科学基金(31860399); 甘肃省现代农业马铃薯产业技术体系项目(GARS-03-P1)

泛素蛋白酶体途径广泛参与植物生长发育的各个阶段,其中泛素结合酶E2是该途径中酶联催化的关键酶,在底物泛素化的过程中发挥着重要的作用。本研究以马铃薯(Solanum tuberosum)栽培品种'大西洋'叶片cDNA为模板,克隆得到马铃薯泛素结合酶E2 (ubiquitin-conjugating enzyme, UBC)基因StUBC12 (GenBank No. XM_006343293.2),该基因全长2 112 bp,包含3个内含子和4个外显子,编码序列(coding sequence, CDS )区长444 bp。生物信息学分析表明,StUBC12为包含148个氨基酸编码的非跨膜蛋白,具有典型的UQ_con保守结构域。用qRT-PCR技术对马铃薯栽培品种'大西洋'和'青薯9号'的根、茎、叶和花进行基因表达量分析,结果表明该基因在叶和花中的表达量最高,且在'大西洋'中的表达量显著高于'青薯9号';在干旱和盐胁迫条件下,马铃薯StUBC12基因通过上调表达提高植株的抗逆性。研究结果可为进一步研究马铃薯StUBC12基因的功能提供理论依据。

来源:2020年第5期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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