农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2020年第8期:绒山羊ALX4基因多态性与绒毛性状相关性分析

发布日期:

作者:张治龙, 吴铁成, 李玉荣, 马跃军, 赵霞, 赵生国, 刘斌, 蔡原

单位:1 甘肃农业大学 动物科学技术学院,兰州 730070;2 内蒙古自治区农牧业科学院 畜牧所,呼和浩特 010031

关键词:绒山羊,无根状同源异型盒-4 (ALX4)基因,多态性,

基金:内蒙古农牧业科技创新基金项目(2017CXJJM03-3;2020CXJJM01);内蒙古自治区科技计划项目“超细超长绒山羊高效育种技术研究与应用”;内蒙古自治区科技成果转化引导项目“绒山羊种质资源创新及标准化高效养殖关键技术示范推广”

在绒山羊(Capra hircus)绒毛生长发育的过程中,不同基因的表达调控在毛囊代谢中发挥着重要作用。本研究选择无根状同源异型盒-4 (aristaless-like homeobox 4, ALX4)为候选基因,旨在验证ALX4基因与绒山羊绒毛性状的相关性,为绒山羊分子标记辅助选育提供依据。首先提取20只绒细度处于最高和最低绒山羊血液DNA,采用PCR扩增技术对ALX4基因的3'-UTR、5'-UTR、外显子、启动子序列进行扩增并测序。根据Blast比对结果,统计ALX4基因发生突变的SNP位点,再利用竞争性等位基因特异性PCR (Kompetitive Allele-Specific PCR, KASP)基因分型技术对315只绒山羊个体进行检测,应用一般线性模型进行SNPs位点与绒毛性状的相关性分析。结果表明,ALX4基因启动子区存在SNP1 (T-1700C),3'-UTR区存在SNP2 (T-14621C)、SNP3 (T-15433C)、SNP4 (G-16377C)、SNP5 (A-17780G)和SNP6 (A-18044G),每个位点均符合Hardy-Weinberg平衡。相关性分析显示,ALX4基因SNP4位点与毛长性状显著相关(P<0.05),GG基因型个体毛长显著高于CC型和CG型个体(P<0.05);SNP6位点与绒细性状显著相关(P<0.05),AA型个体绒细度显著高于GG型和AG型个体(P<0.05);ALX4基因3'-UTR区5个SNPs的不同单倍型组合与毛长性状显著相关(P<0.05),H1H1个体毛长显著高于HIH7、H1H12、H4H7和H7H7 (P<0.05)。以上结果表明,ALX4基因可以作为绒山羊分子标记辅助选育的关键基因,在绒山羊育种工作中可以选择SNP6位点AG基因型个体进行超细绒山羊选育。

来源:2020年第8期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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