农业生物技术学报

作者：谷明娟, 罗荣松, 高丽, 周新宇, 吴迪, 魏著英, 白春玲, 武云喜, 李光鹏

单位：内蒙古大学省部共建草原家畜生殖调控与繁育国家重点实验室,呼和浩特 010070

关键词：蒙古牛,无角性状,全基因组重测序,SNP,InDel,

基金：国家转基因生物新品种培育科技重大专项(2016ZX08007-002);内蒙古科技重大项目(KCBJ2018002)

在现代养殖业中,牛无角性状对提高动物福利、降低养殖成本有重要意义。本研究提取7头蒙古牛(Bos taurus)基因组DNA(其中3头有角,4头无角),制备基因组文库,经Illumina HiSeqTM平台测序,利用生物信息学方法对重测序数据进行分析,对识别的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)和插入缺失(insertion/deletions,InDels)进行注释。结果共得到380.88 Gb序列数据,共确定了11 362 382个SNPs和1 150 664个InDels,大部分变异(96%的SNPs和94%的InDels)位于基因间、转录本和内含子区,注释3 768个基因。经过筛选,确定与角发育相关差异基因20个。同时利用SNPs和InDels进行群体分层分析,发现无角性状没有造成蒙古牛的遗传分化。以全基因组重测序数据结合聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)琼脂糖凝胶电泳和Sanger测序结果,确定控制蒙古牛无角形状的POLLED位点为P219ID突变型。本研究为进一步研究蒙古牛无角性状的分子机制提供基础数据,为蒙古牛的遗传特性提供有价值的资源。

来源：2020年第11期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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