农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2020年第11期:马尾松苗期转录组bHLH基因家族成员鉴定及表达分析

发布日期:

作者:尚先文, 范付华, 周紫晶, 覃慧娟, 王聪慧, 丁贵杰, 谭健晖

单位:1.贵州大学贵州省森林与环境研究中心/高原山地林木培育重点实验室,贵阳 550025; 2.贵州大学林学院,贵阳 550025; 3.广西壮族自治区林业科学研究院,南宁 530002

关键词:马尾松,碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)基因家族,低磷胁迫,表达分析,

基金:国家重点研发计划(2017YFD0600302);国家自然科学基金(31660185);广西创新驱动发展专项(桂科AA17204087-4);贵州省一流学科建设项目(GNYL[2017]007)

植物碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子是真核生物体内第二大类转录因子,在植物的生长发育、次生代谢和逆境响应中起着重要作用。本研究对马尾松(Pinus massoniana)苗期根样品进行转录组测序,筛选出bHLH家族基因序列,运用生物信息学方法对其进行亚细胞定位、保守基序(motif)、表达模式及系统进化等分析。结果显示,从马尾松转录组中共鉴定得到64个马尾松bHLH家族基因,经预测主要定位在细胞核; 保守基序中motif1和motif2出现频率最多; 在低磷胁迫条件下,PmbHLH01/09/27/29/32/39/41等基因呈显著差异表达,可能参与低磷胁迫响应。本研究结果为进一步揭示马尾松bHLH转录因子响应磷素改变的生物学功能提供参考依据。

来源:2020年第11期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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