国内刊号:11-3342/S
国际刊号:1674-7968
发布日期:
作者:崔小芝, 吴巧群, 吴小敏, 朱晓锋, 谌颖莲, 谢玲玲, 赵佳福, 陈伟, 许厚强
单位:1 贵州大学 高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室,贵阳550025; 2 贵州大学 动物科学学院,贵阳550025; 3 贵州大学 医学院,贵阳550025; 4 贵州省种畜禽种质测定中心,贵阳550025
关键词:从江香猪,生长激素受体(GHR),长链非编码RNAs (lncRNAs),差异表达,
基金:国家科技支撑计划(2015BAD03B02-3); 贵州省农业重大产业科学研究攻关项目(黔教合KY字[2019]011); 贵州省科技计划项目(黔科合LH字[2017]7274号); 贵州大学2017年度学术新苗培养及创新探索专项(黔科合平台人才[2017]5788号)
生长激素受体(growth hormone receptor, GHR)在动物生长发育过程中具有重要作用。为研究GHR基因相关长链非编码RNAs (long noncoding RNAs, lncRNAs)在从江香猪(Sus scrofa)不同组织中的表达规律,本研究以贵州从江香猪和大白猪为研究对象,以生长发育相关的miR-146b-3p为关联点,通过SWChen 2.3程序筛选GHR相关lncRNAs,对筛选出来的lncRNAs进行克隆验证。以候选lncRNA NONSUST017828.1 (GenBank No. TCONS_00020564, 命名为lncGHR1)为研究对象,对其进行生物信息学及组织表达谱分析,并构建lncGHR1-CMV超表达载体,转染至人源胚胎肾细胞(human embryonic kidney cells, HEK-293T)和从江香猪原代肌细胞,检测细胞增殖相关基因YAP (Yes-associated protein)和TAZ (transcription activator)的表达情况。结果显示,lncGHR1二级结构最小自由能为-131.20 kcal/mol,含3个ORF;局部比对结果发现,lncGHR1与猪GHR 3'UTR相似程度最高;lncGHR1与miRNA结合的抑制系数为4.96%,其中miR-146-3p与lncGHR1亲和评分最高。lncGHR1在从江香猪脾脏和肺脏中表达量最高,心脏中最低;在大白猪肝脏中表达量最高,心脏中最低;lncGHR1在从江香猪脾脏、肺脏、背最长肌和小肠中的表达量均极显著高于大白猪(P<0.01),但肝脏中的表达量极显著低于大白猪(P<0.01),其他组织表达差异不显著。lncGHR1在HEK-293T细胞和从江香猪原代肌细胞中的超表达,显著提高TAZ基因的表达(P<0.05),但对YAP影响不大(P>0.05)。以上结果表明lncGHR1在生长发育过程中发挥了重要作用,对解析从江香猪生长缓慢、个体矮小的成因机制及猪的遗传改良育种具有重要意义。
来源:2020年第12期
《农业生物技术学报》期刊编辑部