农业生物技术学报

作者：何玉龙, 陶宇, 李勇, 杨易, 周学章, 吴月红

单位：1 浙江理工大学 生命科学学院,杭州 310018;2 宁夏大学 西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室,银川 750021

关键词：miRNA,高通量测序,皮肤,毛囊,小尾寒羊,

基金：国家自然科学基金(No. 31460585)和浙江理工大学启动基金(No. 16042062-Y)

小尾寒羊(Ovis aries)是我国优良的肉裘兼用型绵羊品种,因其生长速度快、产羔率高而闻名。microRNA (miRNA)是参与转录后表达水平调节的重要因子,可参与调控多种动物的皮肤和毛囊的发育。为了阐明miRNAs在小尾寒羊皮肤毛囊发育过程中的调控作用,本研究利用高通量测序技术分析了成年(XWHY_1)、出生30 d (XWHY_2)、刚出生(XWHY_3)等3个时期小尾寒羊皮肤毛囊组织的miRNAs表达谱,在3个不同发育时期共鉴定出1 062个miRNAs,包括已知miRNAs 160个,新发现miRNAs 902个。对鉴定出的miRNAs进行统计分析,在XYHY_1、XYHY_2和XYHY_3中特异性表达的miRNAs数目分别为69、127和73个,而在3个时期共表达的miRNAs为666个。统计分析采用费舍尔精确检验(Fisher exact test)和卡方检验(Chi-square test),对同时满足|log2 (Fold_Change, FC)|≥1且P≤0.05的差异表达miRNAs进行统计,经XWHY_1、XWHY_2、XWHY_3两两比较筛选出339个差异表达miRNAs,去重复后得到226个差异表达miRNAs;进一步进行靶基因预测,得到2 645个靶基因。对差异表达miRNAs进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路(Pathway)富集,2 645个靶基因注释到181个信号通路;对差异表达miRNAs进行基因本体(gene ontology, GO)富集分析,主要包括转录调控、细胞膜组成和离子结合等过程。本研究为在miRNA水平解析皮毛/绒性状形成的分子机理提供了基础资料,同时为保持小尾寒羊现有优良品质的同时通过人工调控手段提高毛/绒产量及品质提供了新的思路。

来源：2019年第1期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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