农业生物技术学报

作者：杭芸, 俞金健, 周世水, 程健弘, 黄华宏, 林二培, 童再康

单位：1 浙江农林大学 亚热带森林培育国家重点实验室,临安 311300;2 浙江省开化县林场,开化 324300

关键词：杉木,木材形成,基于功能基因的SSR标记,关联分析,

基金：浙江省农业新品种选育重大科技专项(No. 2016C02056-5)和国家重点研发计划项目(No. 2017YFD0600201)

开发一套基于杉木(Cunninghamia lanceolata)木材形成相关功能基因的SSR标记,可为后续木材材质性状的分子标记辅助育种提供重要工具。本研究对参与杉木木材形成的10个基因序列进行SSR位点和引物设计,应用毛细管电泳检测引物的有效性和多态性,使用TAASEL(trait analysis by association, evolution and linkage)软件进行SSR位点组合间连锁不平衡(linkage disequilibrium, LD)及其与木材密度的关联分析。在与木材形成相关的7个功能基因中共检测到15个SSR位点。碱基重复形式有二碱基、三碱基、四碱基与六碱基,其中三碱基重复位点所占比例为46.7%。依据SSR位点两侧的保守序列设计了14对PCR扩增引物,其中有7对引物的扩增结果呈现多态性。结合已有的表达序列标签(expressed sequence tag, EST)-SSR数据进行LD分析,检测到644个SSR位点组合皆存在一定程度的LD(D' ≠ 0),其中D'值大于0.5的组合有183个。关联分析发现来自杉木纤维素合成酶基因(C. lanceolata cellulose synthase 3, ClCesA3) 5'非翻译区 (5' untranslated region, 5' UTR)的CLSSR4位点与杉木木材密度极显著关联(P<0.01),该位点对性状变异的解释率为26.07%,且相应等位变异A201和A205对木材密度分别表现为增效和减效效应。本研究共设计筛选出了7对功能基因SSR多态性引物,其中来源于ClCesA3基因5' UTR的SSR位点与杉木木材密度显著关联,为分子标记辅助杉木木材性状改良提供了重要的标记和途径。

来源：2019年第1期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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