国内刊号:11-3342/S
国际刊号:1674-7968
发布日期:
作者:郑浩, 季航, 蒋政勤, 徐芷馨, 周明兵
单位:1 浙江农林大学 省部共建亚热带森林培育国家重点实验室,杭州 311300;2 浙江省竹资源与高效利用协同创新中心,杭州 311300
关键词:LTR反转录转座子,毛竹,顺式作用元件,胁迫,转录活性,
基金:国家自然科学基金(No. 31470615和No. 31870656)、浙江省自然科学基金重点项目(No. LZ19C160001)和浙江省大学生科技创新活动计划暨新苗人才计划资助项目(No. 2018R412004)
反转录转座子作为毛竹(Phyllostachys edulis)基因组中重要组成部分,可以通过自身转座参与毛竹生长发育的调控,获得具有活性的毛竹转座子,对竹子突变育种有着重要意义。本研究鉴定了1条结构完整的毛竹LTR反转录转座子PHRE9 (Phyllostachys edulis retrotransposons 9),系统地分析了PHRE9结构特征和进化模式以及在逆境下的表达模式。通过对PHRE9转座子全长PCR扩增以及生物信息学分析,表明PHRE9全长为6 370 bp,属于Ty1-copia大类中的Tork分支。利用qRT-PCR技术检测了在DNA甲基化抑制剂、辐照、高盐、高温、低温等不同处理条件下,PHRE9的3个结构域的基因转录活性水平。结果表明在DNA甲基化抑制剂处理、辐照、高盐、高温(42 ℃)、低温(4 ℃)胁迫处理下PHRE9表达水平均有上调的现象,表现出转录激活特性。本研究为毛竹逆境适应机制研究以及竹子突变育种提供了基础资料。
来源:2019年第4期
《农业生物技术学报》期刊编辑部