农业生物技术学报

作者：彭曦冉, 俞天奇, 张宜娜, 周继勇, 胡伯里

单位：1 南京农业大学 动物医学院 免疫研究所/教育部动物健康与食品安全国际联合实验室,南京 210095;2 浙江大学 动物医学系/农业部动物病毒学重点实验室,杭州 310058

关键词：传染性法氏囊病病毒(IBDV),高通量测序,转录组,信号通路,

基金：国家自然科学基金(No. 31630077;No. 31502084)

传染性法氏囊病病毒(Infectious bursal disease virus, IBDV)感染鸡(Gallus gallus)引起的IBD是一种严重的、高度传染的免疫抑制性疾病。为探索IBDV感染所引起的宿主细胞转录组变化,本研究以IBDV感染鸡成纤维细胞系DF-1,提取细胞总RNA,使用TruSeq® RNA LT Sample Prep Kit v2构建RNA文库,采用Illumina HiSeq 3000平台进行高通量测序,分析IBDV感染12 h引起的DF-1细胞转录组变化,筛选显著变化基因。实验结果显示,差异表达基因总共有3 417条,其中在IBDV感染组中相对高表达的基因有1 887条,相对低表达的基因有1 530条(差异倍数(Fold change, FC)>2且P≤0.05)。对差异基因进行基因本体(Gene Ontology, GO)注释及KEGG信号通路富集分析,发现IBDV感染能够引起DF-1细胞中免疫、凋亡、代谢等20多条信号通路发生显著变化;其中细胞免疫和细胞凋亡通路可能在IBDV感染和免疫调控机制中具有重要作用。随机选择9条差异表达基因进行qRT-PCR验证,变化趋势与转录组数据一致。本研究为揭示IBDV致病及免疫抑制的分子机制提供了参考信息。

来源：2019年第6期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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