农业生物技术学报

作者：潘静, 房君, 刘春霞, 曹俊伟, 邢燕平, 周欢敏, 张焱如

单位：内蒙古农业大学 生命科学学院/内蒙古生物制造重点实验室,呼和浩特 010018

关键词：可变剪接,德保矮马,蒙古马,矮小性状,

基金：国家自然科学基金(No.31560621)

可变剪接使单个基因产生多个mRNA,从而增强蛋白质的多样性,这与生物的生长发育过程密切相关。在中国丰富的马(Equus caballus)品种资源中,德保矮马和蒙古马具有明显的体高差异。本研究利用与马体尺大小密切相关的垂体组织,经RNA-seq和生物信息学分析,检测出可变剪接事件137 449个,主要以内含子保留(intron retention, IntronR)、可变的3'剪切位点(alternative 3' splice site, A3SS)、可变的5'剪切位点(alternative 5' splice site, A5SS)和外显子跳跃(exon skipping, ES)四种可变剪接类型为主。不同品种、不同生长时期马垂体的差异可变剪接基因共37种,其中,幼年德保矮马与幼年蒙古马的差异可变剪接基因23种,成年德保矮马与成年蒙古马的差异可变剪接基因1种,幼年德保矮马与成年德保矮马的差异可变剪接基因5种,幼年蒙古马与成年蒙古马的差异可变剪接基因8种。而幼年德保矮马垂体中WDR35 (WD repeat-containing protein 35 gene)基因的外显子盒(cassette exon)可变剪接和OSBPL6 (oxysterol binding protein like 6)基因的ES可变剪接则被鉴别为影响德保矮马身高矮小的重要因素。此外,在德保矮马和蒙古马幼年至成年的发育阶段的垂体中,CPEB1、TCF12、CCDC28B、KIT、FAM129A、PTPRF、EPHA5、OGDH、USP28、EMID1、ANKHD1、KIDINS220和INF2共13种发生差异可变剪接的基因也被筛选作为马矮小性状的候选基因。上述矮小相关基因为进一步靶向马体高的分子育种提供了基础资料。

来源：2019年第8期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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