农业生物技术学报

北大核心,CA,JST,CSCD,

国内刊号:11-3342/S

国际刊号:1674-7968

农业生物技术学报杂志2019年第9期:玉米RIL群体SNP偏分离分析

发布日期:

作者:付忠军, 官玲, 张丕辉, 董昕, 李淑君, 陈荣丽, 祁志云, 杨华

单位:重庆市农业科学院,重庆 401329

关键词:玉米,偏分离,SNP,重组自交系(RIL),

基金:国家重点研发计划(No. 2016YFD03003)、重庆市科委社会事业与民生保障科技创新专项(No. cstc2016shms-ztzx80015; No. cstc2016shms-ztzx80013)、重庆市农业科学院创新团队项目(No. NKY-2018QC02)和重庆市科研机构绩效激励引导专项(No. cstc2018jxjl80034)

偏分离是自然界普遍存在的现象,是生物进化的重要动力。随着分子标记技术的发展进步,不同作物的遗传研究中报道了大量偏分离现象,偏分离的比例和遗传效应因物种、群体、标记类型等的不同而变化,并存在偏分离热点区域。为探讨玉米(Zea mays)偏分离现象及其产生原因,本研究以热带玉米自交系B31-3与温带玉米自交系HZ4杂交得到的F8代重组自交系(recombinant inbred lines, RIL)群体为材料,共198份株系,采用MaizeSNP3072芯片对该重组自交系群体进行基因型分析,获得747个在双亲间有多态性的SNP数据,通过偏分离分析发现,有279个SNP标记发生偏分离(P<0.05),占总标记数的37.3%。其中,偏向母本B31-3的SNP有194个,占偏分离SNP的69.5%;偏向父本HZ4的SNP有85个,占偏分离SNP的30.5%。在玉米6条染色体上共发现10个偏分离热点区域。10个偏分离热点区域(segregation distortion regions, SDRs)中仅有3个偏向父本HZ4,另外7个全部偏向母本B31-3。这些偏分离的发生及偏分离热点区域的形成可能与配子体选择及高温环境有关。本研究为探究玉米偏分离规律提供了基础资料。

来源:2019年第9期

《农业生物技术学报》期刊编辑部

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