国内刊号:11-3342/S
国际刊号:1674-7968
发布日期:
作者:高玮, 黄文吉, 邵玲
单位:上海市水产研究所 上海市水产技术推广站,上海 200433
关键词:菊黄东方鲀,鳗弧菌,转录组分析,差异表达基因(DEGs),免疫相关通路,
基金:上海市农业科技创新项目[沪农科(T2024205)]; 上海市青年科技启明星计划(21QA1408300); 上海市自然科学基金项目(21ZR1457800)
菊黄东方鲀(Takifugu flavidus)作为我国重要的海水经济养殖鱼类,其产业发展长期受到鳗弧菌(Vibrio anguillarum)感染的严重威胁,然而宿主应对该病原感染的分子表达模式尚未阐明。为了阐明宿主与病原菌之间互作的分子表达模式,本研究通过转录组测序技术,系统分析了鳗弧菌感染24 h后菊黄东方鲀肝脏组织的基因表达变化。结果共鉴定到3 370个差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),其中上调基因1 930个,下调基因1 440个。GO功能注释表明,这些基因显著富集于细胞因子介导的信号通路、免疫应答、脂多糖应激反应、B细胞增殖、趋化作用、铁离子转运及细胞凋亡等重要生物学过程。KEGG通路分析进一步显示,Toll样受体(Toll-like receptor, TLR)信号通路、RIG-I样受体(retinoic acid-inducible gene-I-like receptor, RLR)信号通路、NOD样受体(NOD-like receptor, NLR)信号通路以及丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase, MAPK)信号通路等免疫相关通路被显著激活。通过qRT-PCR对其4条关键通路中的52个DEGs进行验证,结果显示,其表达趋势与测序数据高度一致。本研究系统解析了菊黄东方鲀应对鳗弧菌感染的肝脏转录组特征,为后续鱼类抗细菌感染的免疫机制提供了新的理论依据。
来源:2026年第2期
《农业生物技术学报》期刊编辑部