国内刊号:11-3342/S
国际刊号:1674-7968
发布日期:
作者:林童, 曾红, 潘滢, 吕艳红, 林能锋
单位:1 福建师范大学 生命科学学院 福建省特色海洋生物资源可持续利用重点实验室,福州 350108;2 福建省农业科学院 生物技术研究所,福州 350001;3 海水养殖生物育种全国重点实验室,宁德 352103
关键词:水滴伪康纤虫,交替氧化酶(AOX),基因克隆,基因家族,表达分析,
基金:国家重点研发计划(2022YFD2401002); 海水养殖生物育种全国重点实验室自由探索课题(MBL25IR10); 中央引导地方科技发展专项(2023L3024)
水滴伪康纤虫(Pseudocohnilembus persalinus)是危害海水养殖动物的盾纤毛类原生动物。本研究通过克隆水滴伪康纤虫交替氧化酶(alternative oxidase, AOX)基因,在基因组水平上对其基因家族进行系统鉴定并预测其生物学功能,解析其表达特征。利用cDNA末端快速克隆(rapid amplification of cDNA ends, RACE)技术获得水滴伪康纤虫AOX3基因的全长cDNA序列;通过Pfam序列PF01786筛选鉴定水滴伪康纤虫AOXs基因家族成员,运用生物信息学方法对其家族成员的理化性质、亚细胞定位预测、基因结构、Scaffold定位、启动子区域顺式元件和系统发育关系等进行了分析,通过qRT-PCR分析水滴伪康纤虫AOXs基因家族成员在营养期与包囊期及在温度胁迫下的表达模式。结果表明,克隆得到水滴伪康纤虫AOX3基因的cDNA全长为1 091 bp (GenBank No. PV953026),其中5'-UTR长度为47 bp,3'-UTR长度为150 bp,ORF总长度为894 bp。在其全基因组中共鉴定到4个AOXs基因家族成员(分别命名为PpAOX1~PpAOX4);PpAOXs均为无信号肽的亲水性蛋白,主要定位于细胞质和线粒体中;启动子顺式作用元件分析显示,PpAOXs可能与响应缺氧诱导、温度和防御应激等胁迫相关;对13个原生动物物种的33个AOXs家族基因进行的系统发育分析显示,水滴伪康纤虫的4个AOXs基因家族成员与寡膜纲类群形成一个支系;qRT-PCR结果显示,PpAOX1在水滴伪康纤虫的营养期表达量较高,而PpAOX2~PpAOX4的表达则在包囊期呈现显著上调;PpAOXs家族成员在应对温度胁迫时,呈现不同的表达模式。本研究为进一步挖掘PpAOXs基因的生物学功能,深入阐释水滴伪康纤虫对逆境胁迫的响应策略提供重要参考资料。
来源:2026年第5期
《农业生物技术学报》期刊编辑部